cellSens軟件包

cellSens Entry

cellSens Entry是初次進(jìn)行數(shù)字圖像采集和文件記錄的研究人員的理想選擇。奧林巴斯的cellSens Entry通過**的定制化界面對相機(jī)進(jìn)行控制，確保了每一位用戶都可以使用自己的設(shè)置采集到想要的圖像。

cellSens Standard

奧林巴斯cellSens Standard是基于cellSens Entry的升級軟件包，圖像采集不限于單一圖像，同時具有高級圖像采集處理能力 (比如延時處理) ，并可以控制電動和編碼顯微鏡組件。測量功能也得到擴(kuò)展，具有多種形態(tài)參數(shù)，以及交互功能且不會影響已測量過的圖像即可自由編輯測量目標(biāo)：僅需要單擊即可將所有結(jié)果導(dǎo)出到Microsoft Excel。cellSens Standard采用了可以增加更多的“Solutions"以增加更多的功能，因此具有可擴(kuò)展性。全景成像和景深擴(kuò)展使顯微鏡不再受到其光學(xué)成像的限制，而NetCam功能使該設(shè)備能夠方便而自由地通過局域網(wǎng)或互聯(lián)網(wǎng)投射實時圖像，用于協(xié)作和教學(xué)目的。

cellSens Dimension

奧林巴斯cellSens系列產(chǎn)品中*的成員是cellSens Dimension，它具有一種**而突出的性能，即新的圖形化實驗管理系統(tǒng)。不用花費(fèi)時間培訓(xùn)，初學(xué)者僅需點擊幾次鼠標(biāo)，“制定"出實驗計劃，即可完成對復(fù)雜研究的成像以及穩(wěn)定的控制。以自動循環(huán)、用戶交互和的硬件控制來完成復(fù)雜的實驗，并從一次實驗中自動產(chǎn)生多個結(jié)果。cellSens Dimension進(jìn)一步以cellSens standard的功能為基礎(chǔ)做了升級，提供包括Z-序列采集、 自動對焦和實時圖像的去模糊等功能。除了能夠控制第三方相機(jī)和光源外，還可以使用高級分析工具快速處理采集到的數(shù)據(jù)，然后輕松地發(fā)送到可定制的報告中，使報告編輯人可以很容易地直接使用Microsoft Word進(jìn)行編輯。此外，還具有被稱為“Solutions"的選配擴(kuò)展插件，以實現(xiàn)一些高級或其他特定的功能。

cellSens Dimension Desktop

離線處理和分析?？蓪⑷魏斡嬎銠C(jī)變?yōu)橐粋€處理和分析工作站。離線軟件包不包括顯微鏡成像系統(tǒng)，僅用來實現(xiàn)圖像處理和分析。

直觀操作進(jìn)行高級的圖像采集

圖形化試驗管理器(GEM)

與常見的面板式復(fù)雜界面不同的是，圖形化試驗管理器(GEM)采用靈活的拖放式界面在cellSens工作區(qū)構(gòu)建簡單或復(fù)雜的試驗。 用于發(fā)出特定命令以及確定自動化和成像優(yōu)先次序的動作整合在專用框架內(nèi)部。 可在一個或多個試樣位置輕松獲得多通道成像、Z軸疊加成像、或延時掃描取圖。 利用cellSens設(shè)備解決方案，圖形化試驗管理器(GEM)?éò?通過同時控制兩個相機(jī)或者圖像分屏器實現(xiàn)雙通道同時成像。 圖形化試驗管理器(GEM)可容許使用者在自動化過程中與系統(tǒng)交互動作，從而應(yīng)對試樣所發(fā)生的不可預(yù)見變化，由此節(jié)約了時間，并避免重復(fù)工作。

多維成像

與電動顯微鏡組合使用時，進(jìn)程管理系統(tǒng)很方便的采集多色和多維圖像。使用選配的多位點解決方案還可以自動采集多點和大視野圖像。

多孔板導(dǎo)航器

多孔板導(dǎo)航器可自動掃描并采集標(biāo)準(zhǔn)及定制孔板格式的圖像。 所有采集到的圖像、試樣位置、以及使用者備注均可保存在結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)庫內(nèi)，供快速集中訪問使用。 簡單的點擊動作即可移動到任一孔的中心。 可按行或列單獨選定孔，也可按不連續(xù)的分組選擇。 一步操作即可將多維采集設(shè)置應(yīng)用到單孔或多個選定孔上。 此外，多孔板導(dǎo)航器可容許在單孔板內(nèi)進(jìn)行多個試驗，為更為復(fù)雜的試驗提供支持。

全景成像

手動多圖像拼接功能可以實時創(chuàng)建全景圖像。 采用cellSens Dimension和選配的多位點解決方案也可以自動操作電動載物臺進(jìn)行大視野成像。此功能還可以與電動z軸對焦組合使用，圖像采集時，自動校正樣本扭曲和傾斜。

景深擴(kuò)展成像

用戶通過樣本緩慢對焦時記錄下圖像數(shù)據(jù)，EFI功能*能自動創(chuàng)建一個全景對焦圖像。如果使用了電動對焦顯微鏡，則可以自動實現(xiàn)EFI處理。此類EFI功能，作為采集處理的一部分，或通過組合以前采集的多個Z-序列圖像來創(chuàng)建。

* 此功能需要 “Dimension"版本或帶“手動處理"解決方案的“standard"軟件包。

復(fù)雜的圖像處理

光譜拆分

cellSens Dimension中使用了線性分離算法，可以隨時分離重疊在發(fā)射光譜里的熒光物質(zhì)—比如GFP和 YFP — ，以產(chǎn)生無串色的熒光圖像。這種線性分離工具也可以分離與自發(fā)熒光相關(guān)的背景。

反卷積

cellSens Dimension包括用于實時預(yù)覽和采集的實時2D去模糊功能，能夠?qū)駱?biāo)本進(jìn)行更好的對焦。此外，cellSens里具有更*的3D反卷積技術(shù)，重 新處理焦外信號。選配的CI反卷積解決方案使用了*新的限制迭代算法，以行業(yè)*的技術(shù)改善了分辨率、對比度和動態(tài)范圍。

細(xì)胞系:人類宮頸癌細(xì)胞系HeLa細(xì)胞
免疫熒光染色:Hec1染色(綠色,Alexa- 488),a-微管蛋白染色(紅色,Alexa- 568),DAPI染色(藍(lán)色)
來源于人類宮頸癌的有絲分裂HeLa細(xì)胞。有絲分裂紡錘體與著絲粒分別用anti-a-tubulin(紅色)和anti-Hec1(綠色)抗體染色。通過著絲粒，染色體與微管相互作用構(gòu)成有絲分裂紡錘體,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)裝配在染色體的著絲粒區(qū)域。
圖像數(shù)據(jù)由日本東北大學(xué)癌癥發(fā)展研究所，分子腫瘤學(xué)系的Masanori Ikeda和Kozo Tanaka提供。

*佳焦點提取

從圖像中提取*佳焦點，包括Z-序列延時圖像。即使在眾多離焦延時圖像中，此功能也能以可能的*佳焦平面創(chuàng)建T-系列圖像。

高動態(tài)范圍 (HDR) 成像

HDR功能以不同的曝光時間自動采集多個圖像，通過這種方法創(chuàng)建具有更高的動態(tài)范圍圖像，這種圖像可清晰地顯示低強(qiáng)度信號，又不會過度曝光樣本的明亮區(qū)域

相機(jī)和設(shè)備解決方案

用于cellSens Dimension的相機(jī)解決方案

為滿足高級研究人員的需求，相機(jī)解決方案允許cellSens Dimension配置一些*新的EM-CCD相機(jī)。相機(jī)控制面板增加一些其它的控制，允許在常規(guī)的cellSens界面中輕松地使用相機(jī)。

用于cellSens Dimension的設(shè)備解決方案

設(shè)備解決方案允許cellSens使用一些高級設(shè)備，比如影像分割器和量壓電動Z軸設(shè)備，從而極大地提高*大采集速度。該解決方案可以控制Yokogawa CSU-X1轉(zhuǎn)盤共聚焦設(shè)備，允許cellSens用戶實時追蹤活樣本快速動態(tài)的活動，并采用奧林巴斯實時控制器獲取可靠的結(jié)果。

多樣的分析方法和宏工具

用于測量和分類的自動目標(biāo)識別

采用計數(shù)和測量解決方案可以進(jìn)一步擴(kuò)展多種測量方式。cellsens軟件中廣泛的手動測量功能可進(jìn)一步擴(kuò)展成計數(shù)和測量方案。在交互式界面識別目標(biāo)的自動測量和分類總是與測量鏈接在一起。結(jié)果可以很方便的導(dǎo)出到Microsoft Excel中做進(jìn)一步分析。

宏管理器

宏管理器用于創(chuàng)建進(jìn)行諸如圖像采集和數(shù)據(jù)分析等常見自動化工作流的宏。  宏命令可同時應(yīng)用于多個圖像，并可顯著縮短完成復(fù)雜成像和圖像分析所需的時間。

圖像比較 (同步圖像窗口)

采用同步縮放和移動并排顯示圖像，進(jìn)行精確比較。

手動測量

點間距離、面積、強(qiáng)度測量值、以及形態(tài)參數(shù)可利用cellSens測量工具進(jìn)行查看。 測量數(shù)據(jù)可作為圖像層保存，并可導(dǎo)出為微軟Excel格式以及cellSens工作本格式，也可使用免費(fèi)的圖像查看軟件包OlyVIA查看。

密度分析

圖形化描述根據(jù)感興趣區(qū)域(ROI) 確定的強(qiáng)度和比率，并調(diào)整感興趣區(qū)域(ROI)的位置，為細(xì)胞運(yùn)動提供補(bǔ)償。 將數(shù)據(jù)直接導(dǎo)出為Excel格式 利用強(qiáng)度調(diào)制顯示功能(IMD)將不同的強(qiáng)度轉(zhuǎn)換為色調(diào)和亮度，突出顯示比率或FRET圖像經(jīng)?？梢姷募?xì)微圖像結(jié)構(gòu)。 比率/FRET解決方案可用于顯示和分析實時比率成像和數(shù)據(jù)。 該人性化工作流亦可為敏化發(fā)射和受體光漂白的FRET分析提供支持。

 
該照片操作解決方案可用于FRAP圖像的曲線擬合分析。

細(xì)胞融合測量

利用相位對比圖像測量細(xì)胞數(shù)量和融合。 由于一次可測量多個圖像，因而使用者可輕松平均數(shù)據(jù)，并生成細(xì)胞生長曲線。

動目標(biāo)計數(shù)和分類 – 點擊計數(shù)

cellSens點擊計數(shù)功能允許研究人員進(jìn)行便捷的手動細(xì)胞計數(shù)。點擊鼠標(biāo)標(biāo)記細(xì)胞或其它目標(biāo)，計數(shù)并自動分配給用戶定義的目標(biāo)分類。為了完成進(jìn)一步的分析或文件記錄，cellSens能夠方便地將數(shù)據(jù)導(dǎo)出到MS excel。

創(chuàng)建報告和數(shù)據(jù)庫

報告

只需簡單的拖拽操作即可使用便捷的報告工具將圖像與參數(shù)數(shù)據(jù)、測量數(shù)據(jù)和用戶定制文檔組合進(jìn)報告模板里。這些Microsoft Word*報告能夠?qū)崿F(xiàn)與同事的快速而輕松的合作，以及交流結(jié)果。

* 需要Microsoft Word version 2007或后續(xù)版本

數(shù)據(jù)庫

數(shù)據(jù)庫核心解決方案允許創(chuàng)建用戶定義的數(shù)據(jù)庫，具有的訪問控制權(quán)限，可以實現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)共享。數(shù)據(jù)庫不但收集圖像，還包括所有相關(guān)的圖像參數(shù)、用戶評論和任何相關(guān)的文件，比如用于其它文件的電子表格。交互式查詢工具使其可以更容易地找到所需的數(shù)據(jù)，自動預(yù)覽找到的圖像。使用數(shù)據(jù)庫客戶解決方案可以從不同的工作站便捷地查看和修改共享數(shù)據(jù)庫。

數(shù)據(jù)庫+孔導(dǎo)航器

在配合孔導(dǎo)航器解決方案使用的情況下，該數(shù)據(jù)庫解決方案利用大量數(shù)據(jù)能夠極大地提高多孔板圖像的觀察和分析效率。 通過點擊圖標(biāo)查看諸如日期、文件名稱、或孔板編號等圖像信息，可對所采集的任何一組圖像進(jìn)行深入分析。 該解決方案還可通過孔板圖形用戶界面（GUI）查看所采集的圖像，并對選定圖像進(jìn)行連續(xù)分析（批處理宏功能）。

可擴(kuò)展性

遠(yuǎn)程實時圖像

cellSens NetCam解決方案使用了標(biāo)準(zhǔn)的TCP/IP協(xié)議，能夠方便地用網(wǎng)絡(luò)傳送實時圖像和保存的圖像用于教學(xué)、監(jiān)視或監(jiān)督。因此，即使在實驗室以外，同事或監(jiān)督員也可以從網(wǎng)絡(luò)上的任何點進(jìn)行監(jiān)視，從而提高了實驗室的效率。

解決方案

使用選配的“Solutions"可以將每個cellSens軟件包擴(kuò)展到指定的應(yīng)用。

個性化和用戶界面

黑色皮膚

黑色皮膚減少了計算機(jī)顯示器產(chǎn)成的環(huán)境光，使cellSens用戶可以適應(yīng)變暗的環(huán)境；圖標(biāo)保持高反差，以便于識別和快速選擇。

可定制的窗口布局

可以安排工具和窗口，以適合正在進(jìn)行的工作，優(yōu)化布局的功能。

工作流定向布局標(biāo)簽

所有常見的功能都集成在標(biāo)簽里，組合了所有相關(guān)的選項和設(shè)置。這些布局標(biāo)簽允許用戶根據(jù)特定的工作流程輕松地選擇想要功能。例如，在采集標(biāo)簽下顯示相機(jī)控制性能。切換到下一個進(jìn)程標(biāo)簽時，則從視圖去掉了這些顯示。

我的功能

cellSens使用戶可以為常用的功能創(chuàng)建并保存定制的工具欄，然后保存到我的功能窗口。

技術(shù)規(guī)格